حرمخانه

در قسمت شرقی، مقبره شاه اسماعیل قرار دارد و اتاقی مربع شکل به طول پنج متر و بین این اتاق و قندیل خانه، اتاقی دیگر مرسوم به راهرو یا کف شکن قرار گرفته استکه تعدادی مقبره را در خود جای داده است.این مقابر عبارت است از:

- قبر شیخ صفی که صندوق منبت کاری دارد.

- قبر دختر شیخ زاهد گیلانی (زن شیخ صفی الدین)به نام فاطمه که ۱۸ روز از مرگ شوهرش به سال ۷۳۵ درگذشته است.

- قبر سید موسی بن سید حیدر متوفی به سال ۷۹۲ ه ق.

- قبر سلطان بایزید خواجه حسین صفوی متوفی به سال ۹۰۸ ه. ق

- قبر سلام الله بن خلیل الله صفوی متوفی به سال ۹۰۹ ه. ق

- قبر مرشد قلی آقا بن الله قلی ایشیک آغاسی از نزدیکان دربار صفوی.